Die Auspuffanlage spielt bei dem KTM V2 (wie auch den anderen V2) eine bedeutende Rolle. Zündkennfeld und Einspritzkennfelder sind beim 31er Map auf die EVO1 abgestimmt ... und die Rohrdurchmesser und Krümmerlängen unterscheiden sich da zur Quat-D. Ein Leistungsverlust dürfte bei der zugestopften Quat-D zudem wahrscheinlich sein. Der db-Eater ist vermutlich auch drin?
Beim P4 muss nichts "abgestimmt" werden. Wenn die Klimabox ordnungsgemäß funktioniert ... was soll es da abzustimmen geben. Was nicht stimmen wird ... ist die korrekte Ermittlung des Übersetzungsverhältnisses. Die Drehzahlzuordnung stimmt so sicher nicht. 
Gut zu erkennen am "zu hohen" Drehmoment und der zu geringen Maximaldrehzahl bei Maximalleistung. Auch das Leistungskurven-Ende ist unrealistisch früh. Da fehlen mindestens 400 U/min. Durch diese Verschiebung in der Leistungsberechnung hast du zwar ein tolles Drehmoment ... aber auch eine zu geringe Maximalleistung. Die Drehzahl sollte also schon möglichst genau der tatsächlichen Motordrehzahl entsprechen.
Wurde die Drehzahl überhaupt an der Zündung abgenommen und die tatsächliche Übersetzung ermittelt ... oder hat er mal auf die Schnelle nur am Tacho abgelesen und manuell einen Übersetzungswert eingegeben?
Hast du keinen Ausdruck der gemessenen Hinterradleistung mitbekommen (P/Mgem)? 
Grüße
Stefan
Dann nimm diese Messung nicht so ernst! 
Selbst bei so einer günstigen Aktion könnte man sich "etwas" mehr Mühe machen mit einer Messung. Kein Wunder wenn derartiges dann einen mehr oder weniger schlechten Ruf bekommt ... was Messergebnisse und deren Realität betrifft. 
Gruß
Stefan