Mein Gluckwunsch! 
Darauf hätt ich nie getippt. Konntest am Kabelaum irgendwelche Fehler wie Kabelbruch oder Scheuerstellen finden?
Beim Tacho kommen eigentlich nur 2 Komponenten in Frage: der Tacho selbst und der Radsensor.
Zum Steuergerät gibt es nur 2 Signale: der Drehzahlimpuls und die FI-Leuchte. Darüber kann der Mist nicht kommen.
Ist die angezeigte Geschwindigkeit irgendwie proportional zur gefahrenen, evtl. sogar ein Vielfaches, oder einfach nur Blödsinn?
naja, so schwer ist es nicht, in einem ausgebauten kabelbaum einen fehler zu finden:
einfach jedes kabel von pin zu pin durchmessen 
Jo, is genauso einfach, wie ein Poti durchzumessen. 
Dummerweise haben Kabelbrüche immer diese blöden geht/geht-nicht/geht Symptome und zum Schluß wars doch ein ausgeleierter Stecker.
naja, ganz offensichtlich ist die geschichte mit dem poti von KTM ganz dezent anders verdrahtet. auf einem regulären poti kannst du nur
gesamtwiderstand und zwei teilwiderstände messen, die dann wieder den gesamtwiderstand ergeben müssen. bauartbedingt.
ausgeleierte stecker kann man so natürlich nicht messen. aber die kann man eigentlich schon optisch recht gut sehen, wenn man eine intakte referenz dazu hat. für kabelbrüche müsste man, während dem messen, an allen knickstellen, die die ader nimmt, mal ordentlich wackeln. oder man macht es rabiat, wie zb ich in der firma, und reißt einfach mal ordentlich an der einzelnen ader an. hast du einen kabelbruch, hast du anschließend zwei teile in der hand. funktioniert immer
Es war also doch der Tacho !
Heute alles wieder zusammengebaut, die Maschine ist wieder wie neu. Die 50 Km Testfahrt war auch erfolgreich.
gratuliere
Hast jetzt nochmal mit TuneECU gemessen? Ist jetzt der Effekt mit den 108% noch da, oder war das mit dem Kabelbaum gefixt?
Das macht die Analyse natürlich umso schwieriger, wenn das Diagnose-Werkzeug nix taugt. Ich wollt mir eigentlich auch noch die Android-Version holen, aber ich denke, damit warte ich noch etwas.
Nicht passende Drosselklappenpotis sollen sich negativ auf den Motorlauf und die Gasannahme auswirken. Wenn du damit keine Probleme hast, würde ich es so lassen.